Struktur organisasi Kodam V/Brawijaya disusun dalam dua tingkat yaitu tingkat Markas Komando dan Tingkat Satuan Pelaksana Kodam V/Brawijaya.

Komando Markas terdiri dari 4 eselon yaitu :
TINGKAT MARKAS KOMANDO
1. Eselon Pimpinan Pangdam V/Brawijaya
2. Eselon Pembantu Pimpinan terdiri dari
a. Kepada Staf Kodam (Kasdam)
b. Asisten Intelijen
c. Asisten Operasi
d. Asisten Personil
e. Asisten Logistik
f. Asisten Teritorial
g. Asisten Perencanaan
3. Eselon Staf Pelayanan terdiri dari :
a. Sekretariat Umum Kodam V/Brawijaya
b. Sandi Kodam V/Brawijaya
c. Informasi & Pengolahan Data Kodam V/Brawijaya
d. Detasemen Markas
4. Eselon Badan Pelaksana Kodam V/Brawijaya
a. Penerangan Kodam V/Brawijaya
b. Pembinaan Mental Kodam V/Brawijaya
c. Jasmani Kodam V/Brawijaya
d. Topografi Kodam V/Brawijaya
e. Badan Pembinaan Administrasi Veteran dan
Cadangan
f. Ajudan Jenderal Kodam V/Brawijaya
g. Perbekalan dan Angkutan Kodam V/Brawijaya
h. Keuangan Kodam V/Brawijaya
i. Hukum Kodam V/Brawijaya
j. Perhubungan Kodam V/Brawijaya
k. Peralatan Kodam V/Brawijaya
l. Zeni Kodam V/Brawijaya
m. Polisi Militer Kodam V/Brawijaya
n. Kesehatan Kodam V/Brawijaya

TINGKAT KOMANDO SATUAN PELAKSANA KODAM
1. Korem 081/DSJ
2. Korem 082/CPYJ
3. Korem 083/BDJ
4. Korem 084/BJ
5. Resimen Induk Militer Kodam V/Brawijaya